Açıklama
NGSgo-AmpX KIR Tiplendirme
NGSgo®-AmpX KIR, 8 KIR geninin5′ UTR’den 3′ UTR’ye tüm gen amplifikasyonunu sağlayarak yeni nesil dizileme teknolojisi ile allel seviyesinde genotipleme sağlar.
NGSgo-AmpX KIR kiti, her biri ayrı ayrı amplifiye edilen aşağıdaki genlerin amplifikasyonu için primerler içerir: KIR2DL1, KIR2DL2, KIR2DL3, KIR2DL4, KIR3DL1, KIR3DS1, KIR3DL2 ve KIR3DL3.
KIR amplifikasyonu, gene özgü bir KIR primeri ve GenDx-LongMix reaktifleri kullanılarak bir termal döngüleyicide gerçekleştirilir. PCR’dan sonra, KIR amplikonları, kontrol amaçlı agaroz jel elektroforezi vasıtasıyla analiz edilir. Ardından KIR amplikon(lar)ı ölçülür ve spesifik kombinasyonlarda birleştirilir.Bir Illumina NGS platformunda dizileme ile birlikte NGSgo kütüphane hazırlama prosedürü (GenDx) kullanıldığında, ortaya çıkan KIR dizileri, KIR genotiplemesi için özel bir veritabanı kullanılarak NGSengine yazılımında (GenDx) analiz edilebilir.
LIFECODES® KIR Tiplendirme Typing Kit
NK (natural killer) hücreleri, sitokinler üretip enfekte hücreleri öldürerek enfeksiyonlarla savaşan doğuştan gelen bağışıklık sisteminin lenfositleridir. Fonksiyonel aktiviteleri, KIR ve hedef hücrede eksprese edilen Sınıf I HLA alelleri arasındaki etkileşim ile düzenlenir. NK hücreleri yüzeylerinde birden fazla KIR tipi içerirler ve bu reseptörler bağışıklıkta engelleyici veya aktive edici olabilir.
19q13.4 kromozomu üzerinde lökosit reseptör kompleksinde (LRC) yer alan 14 KIR geni ve iki psödogen vardır. İnsan NK hücreleri, bu 16 KIR geninin iki ortak haplotip ile çeşitli kombinasyonlarını eksprese eder.
LIFECODES KIR SSO Tipleme kitleri, PCR ile amplifiye edilmiş bir numunede hangi KIR lokuslarının bulunduğunu belirlemek için diziye özgü oligonükleotitleri (SSO’lar) kullanır.
Hem A grubu hem de B grubu KIR haplotiplerinde bulunabilen genler sarı renkle gösterilmiştir.
B grubu KIR haplotiplerine özgü genler ve/veya aleller mavi renkle gösterilmiştir.
KIR amplifikasyonu, gene özgü bir KIR primeri ve GenDx-LongMix reaktifleri kullanılarak bir termal döngüleyicide gerçekleştirilir. PCR’dan sonra, KIR amplikonları, kontrol amaçlı agaroz jel elektroforezi vasıtasıyla analiz edilir. Ardından KIR amplikon(lar)ı ölçülür ve spesifik kombinasyonlarda birleştirilir.Bir Illumina NGS platformunda dizileme ile birlikte NGSgo kütüphane hazırlama prosedürü (GenDx) kullanıldığında, ortaya çıkan KIR dizileri, KIR genotiplemesi için özel bir veritabanı kullanılarak NGSengine yazılımında (GenDx) analiz edilebilir.
